深圳市坪山区疾病预防控制中心于2011年4月28日正式挂牌成立，现加挂“坪山区疾病预防控制中心”“坪山区慢性病防治中心”“坪山区健康教育研究所”“坪山区精神卫生中心”“坪山区职业病防治所”牌子。中心旧办公楼位于坪山区坪山街道宝山第二工业区第二栋，占地面积1545平方米，建筑面积1620平方米；中心新办公楼位于坪山区碧岭街道碧岭公交总站旁，占地面积7078平方米，建筑面积30808平方米，计划2022年下半年建成投入使用。中心主要承担传染病防治、计划免疫、食品卫生、环境卫生、学校卫生、职业病防治、艾滋病防治、疾病和生活饮用水监测。承担卫生检验检测、慢性病和精神病防治、健康教育与促进、突发公共卫生事件处理、卫生人员培训指导等职责。

深圳市坪山区疾病预防控制中心最高行政管理岗位等级为职员六级管理岗，事业单位分类为公益一类，经费形式为财政核拨。中心现有员工78人（职员34人、雇员3人，聘用人员41人），其中本科及以上学历人员70人（博士1人，硕士7人，本科62人）。卫生技术人员有62人，其中正高级职称3人、副高级职称14人、中级职称19人、初级职称16人、未定级10人。